Protein–RNA interactions for Protein: O43248

HOXC11, Homeobox protein Hox-C11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC11O43248 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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HOXC11O43248 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
HOXC11O43248 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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