Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
UBDO15205 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
UBDO15205 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
UBDO15205 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms