Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DMBT1P1-203ENST00000636837 4628 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 REPS1-221ENST00000626459 3665 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FLNC-201ENST00000325888 9188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RCAN3-207ENST00000538532 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 NDUFS7-202ENST00000313408 2818 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
EBAG9O00559 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms