Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E9PBE3 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
E9PBE3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
E9PBE3 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms