Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ERVV-1B6SEH8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.5 ms