Protein–RNA interactions for Protein: A6NGG3

C9orf92, Putative uncharacterized protein C9orf92, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf92A6NGG3 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PCDHB16-201ENST00000609684 5001 ntAPPRIS P1 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 YIPF6-204ENST00000462683 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC090114.2-201ENST00000608477 7054 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AFF2-202ENST00000342251 7313 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC8.99□□□□□ -0.97
C9orf92A6NGG3 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms