Protein–RNA interactions for Protein: A6NDA9

LRIT2, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIT2A6NDA9 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
LRIT2A6NDA9 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
LRIT2A6NDA9 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms