Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AL592295.3-201ENST00000637155 863 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSDA5PKW4 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms