Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CCDC78A2IDD5 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms