Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPP1

PHF8, Histone lysine demethylase PHF8, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF8Q9UPP1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF8Q9UPP1 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF8Q9UPP1 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms