Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH7

SNX6, Sorting nexin-6, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX6Q9UNH7 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SNX6Q9UNH7 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SNX6Q9UNH7 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms