Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NKIRAS1Q9NYS0 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NKIRAS1Q9NYS0 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms