Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
EMILIN3Q9NT22 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms