Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HOMER3Q9NSC5 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms