Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SLCO1B3Q9NPD5 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms