Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB31

SEBOX, Homeobox protein SEBOX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEBOXQ9HB31 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SEBOXQ9HB31 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.8 ms