Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM4Q9C037 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms