Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM5Q9C035 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM5Q9C035 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms