Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ROPN1BQ9BZX4 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms