Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM8Q9BZR9 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM8Q9BZR9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms