Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM55Q9BYV6 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms