Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
TRIM54Q9BYV2 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms