Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXL7

CARD11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD11Q9BXL7 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
CARD11Q9BXL7 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CARD11Q9BXL7 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms