Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HIRIP3Q9BW71 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HIRIP3Q9BW71 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms