Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA1

TUBB2B, Tubulin beta-2B chain, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB2BQ9BVA1 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TUBB2BQ9BVA1 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms