Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 DRC7-202ENST00000360716 3041 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 IL12A-202ENST00000466512 1283 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MAGED2-207ENST00000396224 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SPOCK3Q9BQ16 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms