Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SEMA3CQ99985 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms