Protein–RNA interactions for Protein: Q96S82

UBL7, Ubiquitin-like protein 7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBL7Q96S82 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
UBL7Q96S82 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms