Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCDC114Q96M63 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms