Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP1

CHFR, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHFRQ96EP1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC026954.1-201ENST00000429771 1293 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHFRQ96EP1 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms