Protein–RNA interactions for Protein: Q96EP0

RNF31, E3 ubiquitin-protein ligase RNF31, humanhuman

Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF31Q96EP0 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RNF31Q96EP0 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms