Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
L3HYPDHQ96EM0 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms