Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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ZNF248Q8NDW4 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 TPI1-206ENST00000488464 791 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF248Q8NDW4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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