Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDDC3Q8N4P3 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HDDC3Q8N4P3 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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