Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
UBE2R2Q712K3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms