Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PAX9-202ENST00000402703 3104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
C16orf54Q6UWD8 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms