Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
LRRC8EQ6NSJ5 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.3 ms