Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CENPPQ6IPU0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms