Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATG16L1Q676U5 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms