Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSL9

STRIP1, Striatin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRIP1Q5VSL9 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
STRIP1Q5VSL9 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms