Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
UBAP2Q5T6F2 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms