Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
ODF2Q5BJF6 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ODF2Q5BJF6 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.6 ms