Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SFT2D3Q587I9 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms