Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TMEM259Q4ZIN3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms