Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TWISTNBQ3B726 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TWISTNBQ3B726 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms