Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SPHKAPQ2M3C7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
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