Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HADHQ16836 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HADHQ16836 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HADHQ16836 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HADHQ16836 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HADHQ16836 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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