Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CA9Q16790 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CA9Q16790 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CA9Q16790 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CA9Q16790 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CA9Q16790 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CA9Q16790 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
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CA9Q16790 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CA9Q16790 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CA9Q16790 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CA9Q16790 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CA9Q16790 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CA9Q16790 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
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