Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ACKR1Q16570 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms