Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
HLFQ16534 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
HLFQ16534 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HLFQ16534 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
HLFQ16534 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 HARS2-202ENST00000448069 1426 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
HLFQ16534 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HLFQ16534 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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